El índice de analfabetismo en el Departamento de San Martín es aproximadamente el 12%, que es el promedio nacional, y la inscripción en la escuela primaria es de un 96.5%. 

Superficialmente, el abandono de la escuela (7.3%) y el índice de repitencia (9.1%) no aparentan ser muy altos. Es importante hacer notar que en San Martín, estos porcentajes incluyen escuelas públicas y privadas en áreas rurales y urbanas. Alguna Información recopilada indica que los índices de abandono y repitencia en las escuelas públicas de áreas rurales del departamento son significativamente más altas. 

Los conocimientos académicos por parte de los alumnos en lectura y matemáticas son bajísimos en todo el país y los índices de San Martín se encuentran cerca de los promedios nacionales (ver promedios de lectura y escritura en Cuarto Grado en los siguientes cuadros: